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1) ウミシダをモデルとして、再生の進化的な側面に踏み込む。 多くの動物で何らかの組織に再生の現象が見られる。しかし、すべての種が再生するわけではない。すなわち、再生は後生動物の原始的な特質であり、二次的に失われたと解釈できるが、再生の起源の共通性を支持する証拠は今のところ存在しない。再生の分子的な機構に関しても未解明な部分が多く残されている。それを少しでも解明することを目標に、再生能力が高い棘皮動物であるウミシダを用いて、再生や器官形成に関連する分子を探索する。また、他の門の動物の知見をあわせ、進化的な側面から再生を論ずる。

2) ウミシダ生殖巣の再生現象を解明する。 ウミシダは腕の再生時に生殖巣も再生する。この場合、始原生殖細胞はどこから現れるのか。未分化な細胞が存在するのか。生殖巣形成にあわせて細胞移動は起こるのか。発生と相同な過程なのか。いろいろな疑問の解明に挑戦したい。

3) 棘皮動物の多様性をゲノムの進化から見る。 棘皮動物はボディプランや中枢神経系の有無に見られるように、非常に多様である。様々な生物種のHox遺伝子の解析などを含め、ゲノムを読み解き、進化を見ることによってその多様性がどのように生まれたかを解明したい。

Kondo M., Hornung U., Nanda I., Imai S., Sasaki T., Shimizu A., Asakawa S., Hori H., Schmid M., Shimizu N., Schartl M. (2006) Genomic organization of the sex-determining and adjacent regions of the sex chromosomes of medaka. Genome Research; 16(7): 815-826

Kondo M., Nanda I., Hornung U., Schmid M., Schartl M. (2004) Evolutionary origin of the medaka Y-chromosome. Current Biology; 14: 1664-1669

Kondo M., Nanda I., Hornung U., Asakawa S., Shimizu N., Mitani H., Schmid M., Shima A., Schartl M. (2003) Absence of the candidate male sex determining gene DMRT1bY of medaka in other fish species. Current Biology; 13 (5): 416-420

*Nanda I., *Kondo M., Hornung U., Asakawa S., Winkler C., Shimizu A., Shan Z., Haaf T., Shimizu N., Shima A., Schmid M., Schartl M. (*: equal contribution) (2002) A duplicated copy of DMRT1 in the sex-determining region of the Y chromosome of the medaka, Oryzias latipes. Proc Natl Acad Sci U S A.; 99 (18): 11778-11783.

Kondo M., Froschauer A., Kitano A., Nanda I., Hornung U., Volff JN., Asakawa S., Mitani H., Naruse K., Tanaka M., Schmid M., Shimizu N., Schartl M., Shima A. (2002) Molecular cloning and characterization of DMRT genes from the medaka Oryzias latipes and the platyfish Xiphophorus maculatus. Gene 295 (2): 213-222.