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海洋生物の環境適応機能の研究を行っています。環境適応にかかわる様々な機能遺伝子の解析から、環境適応の分子メカニズムとその進化の歴史をたどり、さらに、生物の分布域との関連の解明を目指します。また、生物の環境適応機能を利用した環境汚染のモニタリングにも挑戦しています。現在の主な研究対象はシンカイヒバリガイ類、シロウリガイ類、ハオリムシ（チューブワーム）類など深海の熱水噴出域にすむ生物、南極海の生態系を支えるナンキョクオキアミ、淡水から海水までユニークな分布を示すアジア各地のメダカ類などです。

井上広滋、小糸智子 (2010) 熱水噴出域への適応機構をアミノ酸輸送体から探る．海洋と生物 32: 123-128.

Inoue, K., Tsukuda, K., Koito, T., Miyazaki, Y., Hosoi, M., Kado, R., Miyazaki, N., and Toyohara, H. (2008) Possible role of a taurine transporter in the deep-sea mussel Bathymodiolus septemdierum in adaptation to hydrothermal vents. FEBS Letters 582: 1542-1546

Inoue, K., Sakamoto, T., Yuge, S., Iwatani, H., Yamagami, S., Tsutsumi, M., Hori, H. Cerra, M.C., Tota, B., Suzuki, N., Okamoto, N. and Takei, Y.(2005) Structural andfunctional evolution of three cardiac natriuretic peptides. Mol. Biol. Evol. 22: 2428-2434.

井上広滋 (2005) 浸透圧的適応．「海洋生物の機能：海洋生命系のダイナミクスシリーズ第２巻」東海大学出版会．pp.18-35.

Inoue, K., Naruse, K., Yamagami, S., Mitani, H., Suzuki, N. and Takei, Y.(2003) Four functionally distinct C-type natriuretic peptides found in fish reveal evolutionary history of vertebrate natriuretic peptides. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100: 10079-10084.